برای آپلود و دانلود فایل‌ها با فایل زیلا، ابتدا باید به سرور خود متصل شده و سپس فایل‌ها را به سادگی از کامپیوتر خود به سرور انتقال دهید. برای این کار هم می‌توانید از منوی این برنامه استفاده کنید و هم می‌توانید با استفاده از کشیدن و رها کردن فایل‌ها در محل مورد نظر خود در سرور یا کامپیوتر خود این کار را انجام دهید.