SSH معمولاً از طریق TCP اجرا می‌شود. سازمان RFC 4251 مشخص می‌کند که پروتکل لایه انتقال SSH  ممکن است در بالای هر جریان داده قابل اعتماد دیگری استفاده شود. تنظیمات پیش‌فرض پروتکل SSH این است که برای اتصالات به درگاه TCP 22 گوش دهد.