مهم‌ترین تفاوت SSL و TLS در مجموعه رمزگذاری آنها نهفته است که به الگوریتم‌های رمزگذاری، روش‌های تبادل کلید و پروتکل‌های احراز هویت مورد استفاده برای امنیت انتقال داده اشاره دارد.